1、在農業生產中也存在計量施用的問題。如果有機肥的用量太多，不僅是一種浪費，一般大田作物每畝施固體有機肥300~500千克，蔬菜和果樹作物每畝施固體有機肥500~1000千克，有機果蔬作物每畝施固體有機肥1000~2000千克。過量有可能造成土壤障礙，影響作物生長發育。應根據土壤中各種養分及有機質的消耗情況合理使用，做到配方施肥、科學施肥。

　　2、有機肥可分為固體有機肥和液體有機肥兩類，一般固體有機肥用作基肥，液體有機肥用作追肥。在使用方法上，粉狀有機肥可在耕作前撒施，顆粒有機肥可撒施，也可通過施肥機根施;液體有機肥可在作物生長不同階段進行噴施、灌施或滴施，配合固體有機肥為作物提供養分。

　　3、腐熟的有機肥不宜與堿性肥料混用，若與堿性肥料混合，會造成氨的揮發，降低有機肥肥效。有機肥(果樹)應采用開溝條施或挖坑穴施，進行集中施肥，施后及時覆土;若采用撒施，施后應翻入土壤。一般大田作物均做底肥。將有機肥與化肥混合施用，效果更佳。如過磷酸鈣與有機肥拌施，能大大提高肥效。